シカの森林被害は土壌微生物にも波及する ―大規模生態系操作実験と環境DNA分析の融合―
現在、日本の森林では、多くの地域において、ニホンジカ（以下、シカ）の食害による植生の荒廃が深刻化しています。シカの食害が森林に与える影響を理解するためには、土壌を含む生態系全体への波及効果の分析が必要となります。植物が減ると土壌の性質や土壌微生物に影響を与え、その影響が植物自体に跳ね返ってくるため、土壌微生物の多様性が低下し、さらなる生態系の変化の引き金となる可能性があるからです。しかし、シカによる食害が、土壌微生物の多様性や種組成にどのような影響を与えるかは明らかになっていませんでした。 京都大学白眉センタ ー 門脇浩明 特定准教授、京都大学生態学研究センター 本庄三恵 准教授、京都大学農学研究科 中村直人 博士課程学生らの研究グループは、芦生（あしう）生物相保全プロジェクト（ABCプロジェクト）メンバーら（京都大学の高柳敦准教授らのグループを中心に、福島大学の福島慶太郎准教授?pt电子游戏_pt老虎机平台-下载*官网の藤木大介准教授?日本大学の井上みずき准教授?国立環境研究所の境優主任研究員ら）との共同研究を行いました。研究では、シカの食害を防ぐ大規模防鹿柵による生態系操作実験と、環境DNA分析のアプローチを組み合わせることで、防鹿柵による長期的な植生の回復?維持が土壌細菌?真菌の多様性を守ることにつながり、とくに、アーキア（古細菌）や担子菌類などの一部の微生物群の多様性を維持する効果があることを示しました。また、防鹿柵を設置していない対照区では防鹿柵内と比べて、動物病原菌が検出されやすくなるなど、従来報告されていなかった土壌微生物群集の変化を検出することに成功しました。今後は、こうした土壌微生物群集の変化が、植生の回復や維持にどのような影響を与えるのかを解明することで、シカの食害が生態系に与える影響の全貌に迫り、生態系回復に資する研究を展開する必要があります。
本成果は、2023年11月28日に国際学術誌「 Environmental DNA 」にオンライン掲載されました。
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論文情報
タイトル
eDNA metabarcoding analysis reveals the consequence of creating ecosystem- scale refugia from deer grazing for the soil microbial communities
（シカによる植生の食害から生態系のリフュージアを作ることが土壌微生物群集に与える影響を環境DNA メタバーコーディング解析によって解明する）
掲載誌
Environmental DNA
DOI : https://doi.org/10.1002/edn3.498
問い合わせ先
研究に関するお問い合わせ先
門脇浩明（かどわき こうめい）
京都大学白眉センター／農学研究科 特定准教授
TEL:080-5750-5988
E-mail:kadowaki.komei.5x@kyoto-u.ac.jp
福島慶太郎（ふくしま けいたろう）
福島大学／食農学類 准教授
E-mail:fmktaro@agri.fukushima-u.ac.jp
報道に関する本学問い合わせ先
pt电子游戏_pt老虎机平台-下载*官网 社会貢献部 地域貢献課
TEL:078-794-6653
E-mail:chiikikouken@ofc.u-hyogo.ac.jp
同時資料提供先
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